南方医科大学南方医院创建于1941年，是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院，全国百佳医院，是国家（创伤）区域医疗中心、广东省高水平医院“登峰计划”首批重点建设单位和国家区域中医（风湿病科）诊疗中心。
南方医院现下辖院本部、增城分院、知识城院区、白云分院、江高院区、太和分院等。院本部坐落在广东省广州市白云山东麓麒麟岗上，拥有广东省花园式院区，曾被评为“全国部门造林绿化400佳单位”。
南方医院设置诊疗科目111个，拥有临床医学一级学科博士学位授权点和临床医学博士后流动站；内科学（消化系病）为国家重点学科，外科学（骨外）为国家重点培育学科；拥有国家临床重点专科建设项目14个，国家中医重点学科4个；设有器官衰竭防治省部共建国家重点实验室、慢性肾病国家临床医学研究中心，国家高等院校学科创新引智基地1个，广东省肾脏病研究所、南方消化病研究所、广东省肝脏疾病研究所。
南方医院在消化病诊治、肾病的综合治疗、血液病治疗、心血管病诊治、肿瘤综合和生物治疗、肾、肝及多器官联合移植技术、神经病学与颅脑外科、显微创伤外科、骨科技术、介入诊疗技术、大面积烧伤救治、重大突发事件的应急救治、整形美容、围产医学与辅助生殖、影像诊断、药学等方面形成明显的技术特色与优势。
2021年，南方医院位列复旦大学医院管理研究所《中国医院及专科声誉排行榜》第18位。
